Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD2Q8NHY2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD2Q8NHY2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFWD2Q8NHY2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFWD2Q8NHY2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFWD2Q8NHY2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFWD2Q8NHY2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD2Q8NHY2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFWD2Q8NHY2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms