Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
COL22A1Q8NFW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
COL22A1Q8NFW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL22A1Q8NFW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
COL22A1Q8NFW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL22A1Q8NFW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
COL22A1Q8NFW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms