Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRPV1Q8NER1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPV1Q8NER1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRPV1Q8NER1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPV1Q8NER1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRPV1Q8NER1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms