Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL23Q8NBE8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL23Q8NBE8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL23Q8NBE8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL23Q8NBE8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHL23Q8NBE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL23Q8NBE8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHL23Q8NBE8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL23Q8NBE8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL23Q8NBE8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms