Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT2Q8N9I0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT2Q8N9I0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT2Q8N9I0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYT2Q8N9I0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT2Q8N9I0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT2Q8N9I0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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