Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC33Q8N5R6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC33Q8N5R6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC33Q8N5R6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC33Q8N5R6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC33Q8N5R6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms