Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MINDY1Q8N5J2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MINDY1Q8N5J2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MINDY1Q8N5J2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MINDY1Q8N5J2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MINDY1Q8N5J2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms