Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SVOPQ8N4V2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVOPQ8N4V2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SVOPQ8N4V2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPQ8N4V2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms