Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RYBPQ8N488 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RYBPQ8N488 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RYBPQ8N488 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RYBPQ8N488 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms