Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
VWDEQ8N2E2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
VWDEQ8N2E2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
VWDEQ8N2E2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
VWDEQ8N2E2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
VWDEQ8N2E2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
VWDEQ8N2E2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
VWDEQ8N2E2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms