Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM1

SEPT12, Septin-12, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT12Q8IYM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SEPT12Q8IYM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SEPT12Q8IYM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEPT12Q8IYM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEPT12Q8IYM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SEPT12Q8IYM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms