Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS6Q8IU80 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS6Q8IU80 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPRSS6Q8IU80 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS6Q8IU80 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS6Q8IU80 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms