Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAD3Q86YD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD3Q86YD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRAD3Q86YD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms