Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RD3Q7Z3Z2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RD3Q7Z3Z2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RD3Q7Z3Z2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RD3Q7Z3Z2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms