Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP54Q7Z3B4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP54Q7Z3B4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP54Q7Z3B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms