Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX8Q7RTT4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX8Q7RTT4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX8Q7RTT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms