Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLRC3Q7RTR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRC3Q7RTR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRC3Q7RTR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRC3Q7RTR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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