Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.476e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.256e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.226e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-211ENST00000487838 473 ntTSL 211.31□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-204ENST00000466246 653 ntTSL 211.01□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-213ENST00000495452 742 ntTSL 310.71□□□□□ -0.696e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-214ENST00000497004 3048 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.816e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-207ENST00000477042 750 ntTSL 59.96□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 43.9
DHX30Q7L2E3 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.573e-16■■■■■ 43.6
DHX30Q7L2E3 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 514.82□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 43.6
DHX30Q7L2E3 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 219.49■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 43.5
DHX30Q7L2E3 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 218.39■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 43.5
DHX30Q7L2E3 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 43.5
DHX30Q7L2E3 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 43.5
DHX30Q7L2E3 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 43.3
DHX30Q7L2E3 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 414.67□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 43.3
DHX30Q7L2E3 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 311.78□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 43.3
DHX30Q7L2E3 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.616e-8■■■■■ 43.3
DHX30Q7L2E3 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 49.86□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 43.3
DHX30Q7L2E3 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.886e-8■■■■■ 43.3
DHX30Q7L2E3 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.26e-8■■■■■ 43.3
DHX30Q7L2E3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 43.1
DHX30Q7L2E3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 43.1
DHX30Q7L2E3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 43.1
DHX30Q7L2E3 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 217.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 42.9
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DHX30Q7L2E3 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 314.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 42.9
DHX30Q7L2E3 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 42.8
DHX30Q7L2E3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 42.6
DHX30Q7L2E3 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 223.29■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 42.6
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DHX30Q7L2E3 RHOF-207ENST00000546227 1219 ntTSL 525.74■■□□□ 1.713e-7■■■■■ 42.5
DHX30Q7L2E3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 42.5
DHX30Q7L2E3 LINC01089-201ENST00000428029 1024 ntTSL 222.42■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 42.5
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DHX30Q7L2E3 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 519.47■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 42.5
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DHX30Q7L2E3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 42.5
DHX30Q7L2E3 LINC01089-208ENST00000541694 875 ntTSL 217.2■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 42.5
DHX30Q7L2E3 EMC10-203ENST00000594508 859 nt25.37■■□□□ 1.653e-10■■■■■ 42.2
DHX30Q7L2E3 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 424.05■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 42.2
DHX30Q7L2E3 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 524.02■■□□□ 1.442e-6■■■■■ 42.2
DHX30Q7L2E3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 42.2
DHX30Q7L2E3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 42.2
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DHX30Q7L2E3 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 42
DHX30Q7L2E3 NUBP2-205ENST00000564227 903 ntTSL 326.39■■□□□ 1.826e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 NUBP2-209ENST00000566090 708 ntTSL 224.85■■□□□ 1.576e-7■■■■■ 41.8
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DHX30Q7L2E3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 NUBP2-207ENST00000565603 995 ntTSL 322.82■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 41.8
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DHX30Q7L2E3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FGB-205ENST00000498375 970 ntTSL 214.04□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 41.8
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DHX30Q7L2E3 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 513.63□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 41.8
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DHX30Q7L2E3 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FGB-202ENST00000425838 565 ntTSL 412.46□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FGB-203ENST00000473984 665 ntTSL 212.02□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FGB-206ENST00000502545 1320 ntTSL 511.48□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FGB-201ENST00000302068 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FKBP5-204ENST00000542713 7384 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 BCR-204ENST00000427791 771 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -01e-6■■■■■ 41.8
DHX30Q7L2E3 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 316.65■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 41.6
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DHX30Q7L2E3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.984e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 327.06■■□□□ 1.924e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 SH2B1-212ENST00000567536 484 ntTSL 326.26■■□□□ 1.794e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 525.8■■□□□ 1.724e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.34e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 420.2■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 NUMBL-210ENST00000600636 555 ntTSL 418.93■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 41.6
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