Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
XIRP1Q702N8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
XIRP1Q702N8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
XIRP1Q702N8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
XIRP1Q702N8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
XIRP1Q702N8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
XIRP1Q702N8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms