Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP47Q6ZTR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP47Q6ZTR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP47Q6ZTR5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms