Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI0

OTOG, Otogelin, humanhuman

Predictions only

Length 2,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOGQ6ZRI0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOGQ6ZRI0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOGQ6ZRI0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOGQ6ZRI0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOGQ6ZRI0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOGQ6ZRI0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOGQ6ZRI0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTOGQ6ZRI0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOGQ6ZRI0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOGQ6ZRI0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOGQ6ZRI0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms