Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CD109Q6YHK3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CD109Q6YHK3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CD109Q6YHK3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
CD109Q6YHK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CD109Q6YHK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CD109Q6YHK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CD109Q6YHK3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms