Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK4Q6UW60 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK4Q6UW60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK4Q6UW60 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms