Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms