Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SARM1Q6SZW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SARM1Q6SZW1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SARM1Q6SZW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SARM1Q6SZW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SARM1Q6SZW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms