Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C19orf48Q6RUI8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C19orf48Q6RUI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C19orf48Q6RUI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms