Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC11Q6PKC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TXNDC11Q6PKC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC11Q6PKC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms