Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNV1Q6PIU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNV1Q6PIU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNV1Q6PIU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNV1Q6PIU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNV1Q6PIU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNV1Q6PIU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms