Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGM2L1Q6PCE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGM2L1Q6PCE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGM2L1Q6PCE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGM2L1Q6PCE3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PGM2L1Q6PCE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGM2L1Q6PCE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGM2L1Q6PCE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms