Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms