Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms