Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF6Q6KF10 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDF6Q6KF10 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF6Q6KF10 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF6Q6KF10 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms