Protein–RNA interactions for Protein: Q6IAA8

LAMTOR1, Ragulator complex protein LAMTOR1, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR1Q6IAA8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMTOR1Q6IAA8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMTOR1Q6IAA8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMTOR1Q6IAA8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms