Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALGAPA1Q6GYQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGAPA1Q6GYQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RALGAPA1Q6GYQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RALGAPA1Q6GYQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms