Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms