Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RPGRIP1LQ68CZ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RPGRIP1LQ68CZ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RPGRIP1LQ68CZ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RPGRIP1LQ68CZ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
RPGRIP1LQ68CZ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms