Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKAP1Q5VSY0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKAP1Q5VSY0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GKAP1Q5VSY0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GKAP1Q5VSY0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms