Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIF1Q5UIP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIF1Q5UIP0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
RIF1Q5UIP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIF1Q5UIP0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms