Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIF1Q5T3J3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRIF1Q5T3J3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIF1Q5T3J3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms