Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FFAR4Q5NUL3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FFAR4Q5NUL3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FFAR4Q5NUL3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FFAR4Q5NUL3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms