Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM47AQ5JRC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM47AQ5JRC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM47AQ5JRC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM47AQ5JRC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM47AQ5JRC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM47AQ5JRC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FAM47AQ5JRC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM47AQ5JRC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM47AQ5JRC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms