Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ESCO2Q56NI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms