Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC0

ATP13A5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A5Q4VNC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms