Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC0

ATP13A5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A5Q4VNC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A5Q4VNC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A5Q4VNC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A5Q4VNC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A5Q4VNC0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms