Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVEP1Q4LDE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SVEP1Q4LDE5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SVEP1Q4LDE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms