Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP221Q4G0U5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP221Q4G0U5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP221Q4G0U5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms