Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLA2G4EQ3MJ16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLA2G4EQ3MJ16 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G4EQ3MJ16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLA2G4EQ3MJ16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms