Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VMACQ2NL98 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VMACQ2NL98 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VMACQ2NL98 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VMACQ2NL98 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms