Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIDA1Q1XH10 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIDA1Q1XH10 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIDA1Q1XH10 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKIDA1Q1XH10 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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