Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNRNP35Q16560 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP35Q16560 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP35Q16560 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRNP35Q16560 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRNP35Q16560 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRNP35Q16560 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRNP35Q16560 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRNP35Q16560 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRNP35Q16560 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRNP35Q16560 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms