Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PKN1Q16512 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PKN1Q16512 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKN1Q16512 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
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