Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNCBQ16143 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNCBQ16143 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNCBQ16143 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNCBQ16143 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNCBQ16143 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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